Существуют различные данные в зависимости от территориальной и расовой принадлежности. В некоторых исследованиях сообщается, что с гипоспадией рождается один мальчик из 125.
В соответствии с результатами исследования, проводившегося в США, гипоспадия является наиболее часто встречающимся врожденным заболеванием среди людей, принадлежащих к европейской расе. Рост случаев этой аномалии зарегистрирован в период с 1990-х годов до конца 2000-х. Обычно родители обращаются к хирургу за оперативной помощью и после проведения коррекции предпочитают не распространяться об этом. По этой причине гипоспадия широко не обсуждается.