Пациентам с головчатой и дистальной, дистально-стволовой формами гипоспадии при нахождении обоих яичек в мошонке хромосомный (генетический) анализ не требуется. При стволо-мошоночной , мошоночной, промежностной гипоспадии (степень IIIb, степень IV) или при сопутствующем неопущения яичек, а также пациентам, у которых имеется подозрение на нарушение полового созревания (НПС), хромосомный (генетический) анализ необходим для точного определения пола ребенка.